Σίγουρα στο πρόγραμμα (pop mail client) που θα χρησιμοποιήσετε θα πρέπει να δηλώσετε στοιχεία όπως:

incoming mail server (δηλώστε τον mail.ntua.gr)
outgoing mail server (δηλώστε τον smtp.ntua.gr)
e-mail address (είναι το username@mail.ntua.gr, όπου username είναι αυτό που δίνετε και στην υπηρεσία dialup)
username & password (αυτά που χρησιμοποιείτε και στην υπηρεσία dialup)

Αναλυτικότερα κοιτάξτε τις οδηγίες χρήσης στην ιστοσελίδα της υπηρεσίας mail.ntua.gr.